การเสด็จสวรรคตของพระบาทสมเด็จพระปรมินทรมหาภูมิพลอดุลยเดช ได้นำมาซึ่งความวิปโยคอย่างใหญ่หลวงของปวงชนชาวไทย เพื่อเป็นการแสดงความอาลัยแด่พระองค์ท่าน มหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวงได้จัดกิจกรรมต่าง ๆ น้อมเกล้าน้อมกระหม่อมรำลึกในพระมหากรุณาธิคุณอันหาที่สุดมิได้
วันที่ 13 ตุลาคม 2559 ณ ลานเฉลิมพระเกียรติฯ อธิการบดีมหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวง พร้อมด้วย ผู้บริหาร คณาจารย์ พนักงาน และนักศึกษา ร่วมกันรำลึกถึงพระมหากรุณาธิคุณอันหาที่สุดมิได้ของพระบาทสมเด็จพระปรมินทรมหาภูมิพลอดุลยเดช
พิธีจุดเทียนแสดงความอาลัยและสำนึกในพระมหากรุณาธิคุณเนื่องในโอกาสครบ 1 ปี แห่งการสวรรคต วันศุกร์ที่ 13 ตุลาคม พ.ศ. 2560 ณ ลานเฉลิมพระเกียรติ สมเด็จพระศรีนครินทราบรมราชชนนี ภาพกิจกรรม
วันที่ 14 ตุลาคม 2559 มีการจัดแต่งสถานที่ และจัดพื้นที่เพื่อประกอบพิธีลงนามแสดงความอาลัย ณ โถงอาคาร C1 และในเวลา 17.00 น. ได้จัดพิธีแสดงความอาลัยต่อการสวรรคตของพระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวภูมิพลอดุลยเดช ณ ลานเฉลิมพระเกียรติ
การมอบดอกไม้จันทน์ จากโครงการ “ดอกไม้จันทน์เพื่อพ่อ” ภาพกิจกรรม
วันที่ 27 ตุลาคม 2559 เวลา มหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวง ร่วมกับจังหวัดเชียงราย จัดพิธีบำเพ็ญพระราชกุศลกุศลปัณรสมวาร (15 วัน) เพื่อถวายเป็นพระราชกุศลแด่พระบาทสมเด็จพระปรมินทรมหาภูมิพลอดุลยเดช ณ ลานเฉลิมพระเกียรติ
การจัดนิทรรศการ “แรงบันดาลใจจากพ่อ” เนื่องในพระราชพิธีถวายพระเพลิง พระบาทสมเด็จพระปรมินทรมหาภูมิพลอดุลยเดช ณ พระเมรุมาศจำลอง ฝูงบิน 416 อ.เมือง จ.เชียงราย ภาพกิจกรรม
มหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวง จัดทำเว็บไซต์เผยแพร่ข้อมูล พระบาทสมเด็จพระปรมินทรมหาภูมิพลอดุลยเดชที่ http://web2.mfu.ac.th/kingbhumibol/
พิธีบำเพ็ญกุศลถวายเป็นพระราชกุศล พระบาทสมเด็จพระปรมินทรมหาภูมิพลอดุลยเดช บรมราชบพิตร วันศุกร์ที่ 12 ตุลาคม พ.ศ. 2561 ณ หอประชุมสมเด็จย่า มหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวง ภาพกิจกรรม
วันที่ 28 ตุลาคม 2559 มหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวงได้นิมนต์พระสงฆ์จำนวน 70 รูป เพื่อประกอบพิธีเจริญพระพุทธมนต์ และทำบุญตักบาตรเพื่อถวายเป็นพระราชกุศลแด่พระบาทสมเด็จพระปรมินทรมหาภูมิพลอดุลยเดช